河野准教授の論文（国際共同研究）がNature Methodsに掲載されました！
河野准教授の論文（国際共同研究）がNature Methodsに掲載されました！
論文記事
https://www.nature.com/articles/s41592-021-01184-6
タイトル
Universal Spectrum Identifier for mass spectra
著者
Eric W Deutsch, Yasset Perez-Riverol, Jeremy Carver, Shin Kawano, Luis Mendoza, Tim Van Den Bossche, Ralf Gabriels, Pierre-Alain Binz, Benjamin Pullman, Zhi Sun, Jim Shofstahl, Wout Bittremieux, Tytus D Mak, Joshua Klein, Yunping Zhu, Henry Lam, Juan Antonio Vizcaíno, Nuno Bandeira
概要
生体中のタンパク質は質量分析計を使って測定され、データとして質量スペクトルが得られます。現在、さまざまな生体試料の中に含まれているタンパク質の全体（プロテオーム）を測定する研究が進んでおり、実験で得られた大量の質量スペクトルがjPOST [https://repository.jpostdb.org/] をはじめとする公共リポジトリ（データ保存サイト）に登録されています。今回発表したUniversal Spectrum Identifier (USI) は、公共リポジトリに保存されている個々の質量スペクトルに対して、それぞれ固有のIDを付与するための命名規則について定めたものです。これにより、個々の質量スペクトルにインターネットからアクセスすることが可能になりました。これまでデータセット単位での利用が主だったプロテオームのデータをスペクトル単位で利用することができるようになり、研究の再現性の確保や人工知能を用いたプロテオーム研究に貢献することが期待されます。
なお、今回掲載された論文は編集の都合上概要版となっており、bioRxiv [https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.07.415539v2] にて全文を読むことができます。
DOI：10.1038/s41592-021-01184-6